Thomas Wittenberg

2022

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  In: Current Directions in Biomedical Engineering 8 (2022), p. 277-280
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  DOI: 10.1515/cdbme-2022-1071
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• Kress V., Wittenberg T., Raithel M., Bruns V., Lehmann E., Eixelberger T., Hackner R.:
  Automatic detection of foreign objects and contaminants in colonoscopic video data using deep learning
  In: Current Directions in Biomedical Engineering 8 (2022), p. 321-324
  ISSN: 2364-5504
  DOI: 10.1515/cdbme-2022-1082
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• Weigand C., Flemming D., Zweyer G., Borutta P., Hofmann F., Wieland G., Hayir E., Seuß D., Wittenberg T.:
  A concept and technical requirements for the Temi platform supporting care and nursing
  In: Current Directions in Biomedical Engineering 8 (2022), p. 241-244
  ISSN: 2364-5504
  DOI: 10.1515/cdbme-2022-1062
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  Fast whole-slide cartography in colon cancer histology using superpixels and CNN classification
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• Zöller N., Franke L., Claussen J., Gerth S., Rauh C., Radlanski RJ., Hiller KH., Hildenbrand MF., Wittenberg T., Hufnagel E.:
  Evaluation of methods for 3D imaging and analysis of vascularisation in biopreparations
  In: Current Directions in Biomedical Engineering 8 (2022), p. 61-64
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2021

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• Hackner R., Suarez-Ibarrola R., Qiu T., Lemke N., Pohlmann PF., Wilhelm K., Fischer P., Miernik A., Wittenberg T.:
  Panoramic Imaging Assessment of Different Bladder Phantoms – An Evaluation Study
  In: Urology (2021)
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• Hackner R., Walluscheck S., Lehmann E., Eixelberger T., Bruns V., Wittenberg T.:
  A Geometric and Textural Model of the Colon as Ground Truth for Deep Learning-based 3D-reconstruction
  German Workshop on Medical Image Computing, 2021 (Regensburg, March 7, 2021 - March 9, 2021)
  In: Christoph Palm, Heinz Handels, Klaus Maier-Hein, Thomas M. Deserno, Andreas Maier, Thomas Tolxdorff (ed.): Informatik aktuell 2021
  DOI: 10.1007/978-3-658-33198-6_73
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• Steger J., Zimmermann A., Wittenberg T., Wilhelm D.:
  Electromagnets for an endoscopic anastomosis tool in the colon
  In: Current Directions in Biomedical Engineering 7 (2021), Article No.: 20211110
  ISSN: 2364-5504
  DOI: 10.1515/cdbme-2021-1009
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2020

• Bauer J., Wittenberg T., Waldhör K., Hechtel M., Holzwarth M., Seßner J., Ristok B., Böhle F., Schena A., Falanga A., Franke J.:
  A Concept for Context Awareness in SmartEnvironments
  In: Current Directions in Biomedical Engineering (2020)
  ISSN: 2364-5504
  DOI: 10.1515/cdbme-2020-3098
  URL: https://www.degruyter.com/document/doi/10.1515/cdbme-2020-3098/html
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• Eixelberger T., Parchent J., Janka RM., Stamminger M., Döllinger M., Wittenberg T.:
  Haptic Rendering of Soft-Tissue for Training Surgical Procedures at the Larynx
  Algorithmen – Systeme – Anwendungen (Berlin, March 15, 2020 - March 17, 2020)
  In: In: Tolxdorff T., Deserno T., Handels H., Maier A., Maier-Hein K., Palm C. (eds) (ed.): Bildverarbeitung für die Medizin 2020, Informatik aktuell, Wiesbaden: 2020
  DOI: 10.1007/978-3-658-29267-6_76
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• Hackner R., Raithel M., Lehmann E., Wittenberg T.:
  Deep-learning based reconstruction of the stomach from monoscopic video data
  In: Current Directions in Biomedical Engineering 6 (2020)
  ISSN: 2364-5504
  DOI: 10.1515/cdbme-2020-3012
  URL: https://www.degruyter.com/document/doi/10.1515/cdbme-2020-3012/html
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2019

• Bergler M., Benz M., Rauber D., Hartmann D., Kötter M., Eckstein M., Schneider-Stock R., Hartmann A., Merkel S., Bruns V., Wittenberg T., Geppert C.:
  Automatic Detection of Tumor Buds in Pan-Cytokeratin Stained Colorectal Cancer Sections by a Hybrid Image Analysis Approach
  European Congress on Digital Pathology (Warwick , UK, April 10, 2019 - April 13, 2019)
  In: Reyes-Aldasoro CC, Janowczyk A, Veta M, Bankhead P, Sirinukunwattana K (ed.): Digital Pathology, Cham: 2019
  DOI: 10.1007/978-3-030-23937-4_10
  URL: https://link.springer.com/chapter/10.1007/978-3-030-23937-4_10
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• Klare P., Sander C., Prinzen M., Haller M., Nowack S., Abdelhafez M., Poszler A., Brown H., Wilhelm D., Schmidt RM., von Delius S., Wittenberg T.:
  Automated polyp detection in the colorectum: a prospective study (with videos)
  In: Gastrointestinal Endoscopy 89 (2019), p. 576-582.e1
  ISSN: 0016-5107
  DOI: 10.1016/j.gie.2018.09.042
  URL: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/30342029
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• Rüger S., Firsching M., Lucic J., Ennen A., Uhlmann N., Wittenberg T.:
  Automated detection of bone splinters in DEXA phantoms using deep neural networks
  In: Current Directions in Biomedical Engineering 5 (2019), p. 281-283
  ISSN: 2364-5504
  DOI: 10.1515/cdbme-2019-0071
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2018

• Bergler M., Weiherer M., Bergen T., Avenhaus M., Rauber D., Wittenberg T., Münzenmayer C., Benz M.:
  Stitching Pathological Tissue Images using DOP Feature Tracking
  Bildverarbeitung für die Medizin (Erlangen)
  In: Maier A, Deserno TM, Handels H, Maier-Hein KH, Palm C, Tolxdorff T (ed.): Bildverarbeitung für die Medizin 2018, Berlin, Heidelberg: 2018
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• Eixelberger T., Wittenberg T., Perret J., Katzky U., Simon M., Schmitt-Rüth S., Hofer M., Sorge M., Jacobs R., Engel F., Gostian AO., Palm C., Franz D.:
  A haptic model for virtual petrosal bone milling
  Proc’s 17. Jahrestagung der Deut¬schen Ge¬sellschaft für Computer- und Roboterassistierte Chirurgie (CURAC 2018) (Leipzig, September 14, 2018 - September 16, 2018)
  Open Access: https://www.curac.org/images/advportfoliopro/images/CURAC2018/CURAC 2018 Tagungsband.pdf
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• Franz D., Dreher M., Prinzen M., Teßmann M., Palm C., Katzky U., Perret J., Hofer M., Wittenberg T.:
  CT-basiertes virtuelles Fräsen am Felsenbein --- Bild- und haptische Wiederholfrequenzen bei unterschiedlichen Rendering Methoden
  Workshop Bildverarbeitung für die Medizin 2018 (Erlangen, March 11, 2018 - March 13, 2018)
  In: Andreas Maier, Thomas M. Deserno, Heinz Handels, Klaus Hermann Maier-Hein, Christoph Palm,Thomas Tolxdorff (ed.): Bildverarbeitung für die Medizin 2018
  Algorithmen - Systeme - Anwendungen. Proceedings des Workshops vom 11. bis 13. März 2018 in Erlangen, Heidelberg: 2018
  DOI: 10.1007/978-3-662-56537-7_51
  URL: https://link.springer.com/chapter/10.1007/978-3-662-56537-7_51
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• Hackner R., Hann A., Franz D., Meining A., Raithel M., Wittenberg T.:
  Panoramic Endoscopy of the Stomach: First results from Phantom and Patient Data.
  17. Jahrestagung der Deutschen Gesellschaft für Computer- und Roboterassistierte Chirurgie (CURAC 2018) (Leipzig, September 14, 2018 - September 16, 2018)
  In: Thomas Neumuth, Andreas Melzer, Claire Chalopin (ed.): Proc's 17. Jahrestagung der Deutschen Gesellschaft für Computer- und Roboterassistierte Chirurgie (CURAC 2018) 2018
  Open Access: https://www.curac.org/images/advportfoliopro/images/CURAC2018/CURAC 2018 Tagungsband.pdf
  URL: https://www.curac.org/images/advportfoliopro/images/CURAC2018/CURAC 2018 Tagungsband.pdf
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• Hofer M., Pirlich M., Sorge M., Dietz A., Franz D., Wittenberg T.:
  3D haptic training system for micorsurgery of the ear – BMBF-Haptivist
  In: Laryngo-Rhino-Otologie 97 (2018), p. 10741
  ISSN: 0935-8943
  DOI: 10.1055/s-0038-1640365
  URL: https://www.thieme-connect.de/products/ejournals/abstract/10.1055/s-0038-1640365
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• Maier J., Huber M., Katzky U., Perret J., Wittenberg T., Palm C.:
  Force-Feedback Assisted Bone Drilling Simulation Based on CT Data
  Workshop Bildverarbeitung für die Medizin 2018, (Erlangen, March 11, 2018 - March 13, 2018)
  In: Andreas Maier, Thomas Deserno, Heinz Handels, Klaus Maier-Hein, Christoph Palm, Thomas Tolxdorff (ed.): Bildverarbeitung für die Medizin 2018
  Algorithmen - Systeme - Anwendungen. Proceedings des Workshops vom 11. bis 13. März 2018 in Erlangen, Heidelberg: 2018
  DOI: 10.1007/978-3-662-56537-7_78
  URL: https://link.springer.com/chapter/10.1007/978-3-662-56537-7_78
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• Unterer B., Wiesmann V., Gunasekaran M., Sticht H., Tenkerian C., Behrens J., Leone M., Engel F., Britzen-Laurent N., Naschberger E., Wittenberg T., Stürzl M.:
  IFN-γ-response mediator GBP-1 represses human cell proliferation by inhibiting the Hippo signaling transcription factor TEAD
  In: Biochemical Journal 475 (2018), p. 2955-2967
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  DOI: 10.1117/12.2254036
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• Haeberle L., Hack C., Heusinger K., Wagner F., Jud S., Uder M., Beckmann M., Schulz-Wendtland R., Wittenberg T., Fasching P.:
  Using automated texture features to determine the probability for masking of a tumor on mammography, but not ultrasound
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  ISSN: 0949-2321
  DOI: 10.1186/s40001-017-0270-0
  URL: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5577694/
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• Krappe S., Benz M., Gryanik A., Tannich E., Wegner C., Stamminger M., Wittenberg T., Münzenmayer C.:
  Automated plasmodia recognition in microscopic images for diagnosis of malaria using convolutional neural networks
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• Kriegmayr M., Bergen T., Ritter M., Mandel P., Michel M., Wittenberg T., Bolenz C.:
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  In: Urology 104 (2017), p. 235-241
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  Analysis of Corynebacterium diphtheriae macrophage interaction: Dispensability of corynomycolic acids for inhibition of phagolysosome maturation and identification of a new gene involved in synthesis of the corynomycolic acid layer
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• Wiesmann V., Bergler M., Franz D., Palmisano R., Prinzen M., Wittenberg T.:
  Using simulated fluorescence cell micrographs for the evaluation of cell image segmentation algorithms
  In: BMC Bioinformatics 18 (2017), p. 176
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  In: IEEE Journal of Biomedical and Health Informatics 20 (2016), p. 304-321
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• Bergen T., Wittenberg T., Münzenmayer C.:
  Shading correction for endoscopic images using principal color components
  In: International Journal of Computer Assisted Radiology and Surgery 11 (2016), p. 397-405
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  DOI: 10.1007/s11548-015-1273-3
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• Krappe S., Benz M., Wittenberg T., Haferlach T., Münzenmayer C.:
  Automated classification of bone marrow cells in microscopic images for diagnosis of leukemia: A comparison of two classification schemes with respect to the segmentation quality
  Medical Imaging 2015: Computer-Aided Diagnosis (Orlando, February 21, 2015 - February 26, 2015)
  In: Proc. SPIE 9414, 2015
  DOI: 10.1117/12.2081946
  URL: https://spie.org/Publications/Proceedings/Paper/10.1117/12.2081946
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• Krappe S., Münzenmayer C., Evert A., Can K., Cetin E., Haferlach T., Wittenberg T., Held C.:
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  Bildverarbeitung für die Medizin 2015 (Lübeck, March 15, 2015 - March 17, 2015)
  In: Bildverarbeitung für die Medizin 2015, Heidelberg: 2015
  DOI: 10.1007/978-3-662-46224-9_62
  URL: http://link.springer.com/chapter/10.1007/978-3-662-46224-9_62
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• Prinzen M., Raithel M., Bergen T., Mühldorfer S., Nowack S., Wilhelm D., Wittenberg T.:
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  Bildverarbeitung für die Medizin 2015 (Lübeck, March 15, 2015 - March 17, 2015)
  In: Heinz Handels, Thomas Martin Deserno, Hans-Peter Meinzer, Thomas Tolxdorff (ed.): Bildverarbeitung für die Medizin 2015, Heidelberg: 2015
  DOI: 10.1007/978-3-662-46224-9_78
  URL: http://link.springer.com/chapter/10.1007/978-3-662-46224-9_78
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  Bildverarbeitung für die Medizin 2015 (Lübeck, March 15, 2015 - March 17, 2015)
  In: Heinz Handels, Thomas Martin Deserno, Hans-Peter Meinzer, Thomas Tolxdorff (ed.): Bildverarbeitung für die Medizin 2015, Heidelberg: 2015
  DOI: 10.1007/978-3-662-46224-9_31
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  URL: http://link.springer.com/article/10.1007/s00287-015-0913-x
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  In: Biomedizinische Technik 59 (2014), p. 559-562
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• Franz D., Wiesmann V., Stamminger M., Wittenberg T.:
  Cell-Shape Wizard – A Concept for User-Guidance for Active Shape Segmentation in Fluorescence Cell Micrographs
  In: Biomedizinische Technik 59 (2014), p. 877-880
  ISSN: 0013-5585
  DOI: 10.1515/bmt-2014-5011
  URL: http://www.degruyter.com/view/j/bmte.2014.59.issue-5/issue-files/bmte.2014.59.issue-5.xml
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  Computer-Aided Detection of Lesions in Digital Breast Tomosynthesis Images
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  In: Thomas Martin DesernoHeinz HandelsHans-Peter MeinzerThomas Tolxdorff (ed.): Bildverarbeitung für die Medizin 2014, Heidelberg: 2014
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  DOI: 10.2174/1573405611309020002
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  DOI: 10.1002/cyto.a.21122
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• Wenzel J., Held C., Palmisano R., Teufel S., David JP., Wittenberg T., Lang R.:
  Measurement of TLR-induced macrophage spreading by automated image analysis: Differential role of Myd88 and MAPK in early and late responses
  In: Frontiers in Physiology 2 OCT (2011)
  ISSN: 1664-042X
  DOI: 10.3389/fphys.2011.00071
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2010

• Höller KE., Hempel SM., Schneider A., Jahn J., Gutierrez J., Wittenberg T., Hornegger J., Feußner H.:
  Rectification of Endoscopic Images by Gravity
  In: Proc. Pattern Recognition in Medical and Health Engineering ’10, Erlangen: Kloster Banz, 2010, p. 105-107
  URL: http://www5.informatik.uni-erlangen.de/Forschung/Publikationen/2010/Hoeller10-ROE.pdf
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• Höller KE., Schneider A., Jahn J., Gutierrez J., Wittenberg T., Feussner H., Hornegger J.:
  Spatial orientation in translumenal surgery
  In: Minimally Invasive Therapy & Allied Technologies 19 (2010), p. 262-273
  ISSN: 1364-5706
  DOI: 10.3109/13645706.2010.510762
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• Höller KE., Schneider A., Jahn J., Gutierrez J., Wittenberg T., Meining A., Von Delius S., Hornegger J., Feussner H.:
  Orientation of endoscopic images: Rectification by gravity
  In: Biomedizinische Technik 55 (2010), p. 211-217
  ISSN: 0013-5585
  DOI: 10.1515/BMT.2010.032
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2009

• Höller KE., Penne J., Hornegger J., Schneider A., Gillen S., Feußner H., Jahn J., Gutierrez J., Wittenberg T.:
  Clinical Evaluation of Endorientation:Gravity related rectification for endoscopic images
  6th International Symposium on Image and Signal Processing and Analysis, ISPA 2009 (Salzburg)
  URL: https://www.scopus.com/record/display.uri?eid=2-s2.0-70450273232&origin=inward
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• Höller KE., Penne J., Schneider A., Jahn J., Girgis H., Guttierrez J., Wittenberg T., Feußner H., Hornegger J.:
  Suppression of shock based errors with gravity related endoscopic image rectification
  5th Russian-Bavarian Conference on Biomedical Engineering (München, July 1, 2009 - July 4, 2009)
  In: Feussner Hubertus, et al. (ed.): Proceedings of the 5th Russian-Bavarian Conference on Biomedical Engineering, München: 2009
  URL: http://www5.informatik.uni-erlangen.de/Forschung/Publikationen/2009/Hoeller09-SOS.pdf
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• Höller KE., Penne J., Schneider A., Jahn J., Guttierrez J., Wittenberg T., Feußner H., Hornegger J.:
  Endoscopic orientation correction
  Heidelberg: Springer-verlag, 2009
  ISBN: 978-3-642-04267-6
  DOI: 10.1007/978-3-642-04268-3_57
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2006

• Göb S., Maier Tobias, Benz Michaela, Ettl Svenja, Wittenberg Thomas, Kullmann W., Nkenke Emeka, Neukam F.W., Häusler Gerd:
  Automatische Segmentierung der Gewebegrenzen in 2D-Ultraschalldaten aus der Mund-Kiefer- und Gesichtschirurgie
  In: Informatik aktuell (2006), p. -
  ISSN: 1431-472X
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2005

• Winter C., Rupp S., Münzenmayer C., Gerhäuser H., Wittenberg T., Spinnler K. (ed.):
  Adaptive Rasterreduktion in Aufnahmen von flexiblen Endoskopen durch spektrale Maskierung
  Heidelberg: 2005
  (Bildvrarbeitung für die medizin 2005 - Algorithmen, Systeme, Anwendungen, Vol. Informatike aktuell)
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• Wittenberg T., Nkenke E., Hornegger J.:
  Interdisciplinary research! Was it worthwhile?
  35th Jahrestagung der Gesellschaft fur Informatik e.V. (GI): Informatik LIVE!, INFORMATIK 2005 35th Annual Conference of the German Informatics Society (GI): Informatics LIVE!, INFORMATIK 2005 (Bonn)
  URL: https://www.scopus.com/record/display.uri?eid=2-s2.0-84877320097&origin=inward
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2003

• Wittenberg T., Hastreiter P., Hoppe U., Handels H., Horsch A., Meinzer HP. (ed.):
  Bildverarbeitung für die Medizin 2003
  Heidelberg: 2003
  (Informatik Aktuell)
  ISBN: 978-3-540-00619-0
  DOI: 10.1007/978-3-642-18993-7
  URL: http://link.springer.com/book/10.1007/978-3-642-18993-7/page/1
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2001

• Haderlein T., Wittenberg T., Decher M., Nöth E.:
  Automatische Stottererkennung und Klassifikation mit Hilfe von Hidden-Markov- Modellen
  In: M.Gross, E. Kruse (ed.): Aktuelle phoniatrisch-pädaudiologische Aspekte 2000/2001, Heidelberg: Median-Verlag, 2001, p. 124-130
  ISBN: 3-992766-74-9
  URL: http://www5.informatik.uni-erlangen.de/Forschung/Publikationen/2001/Haderlein01-ASU.pdf
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2000

• Nöth E., Niemann H., Haderlein T., Decher M., Eysholdt U., Rosanowski F., Wittenberg T.:
  Automatic Stuttering Recognition using Hidden Markov Models
  ICSLP 2000 (Beijing, October 16, 2000 - October 20, 2000)
  In: Yuan B., Huang T., Tang X. (ed.): Proc. Int. Conf. on Spoken Language Processing, -: 2000
  URL: http://www5.informatik.uni-erlangen.de/Forschung/Publikationen/2000/Noeth00-ASR.pdf
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1997

• Jesorsky O., Denzler J., Nöth E., Wittenberg T.:
  Analysis of voice-onset using active rays and hidden markov models
  Advances in Quantitative Laryngoscopy (Erlangen, July 18, 1997 - July 19, 1997)
  In: - (ed.): Advances in Quantitative Laryngoscopy, -: 1997
  Open Access: https://pdfs.semanticscholar.org/5d96/c311c0dd4780edd67de41589cacec9226f59.pdf
  URL: http://www5.informatik.uni-erlangen.de/Forschung/Publikationen/1997/Jesorsky97-AOV.pdf
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